| MirGeneDB ID | Oan-Mir-1362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | oan-mir-1362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041753.1: 161271-161330 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1362) |
Mir-1362
NC_041753.1: 161271-161330 [-]
Mir-9-P3-v1 NC_041753.1: 164722-164782 [-] Mir-9-P3-v2 NC_041753.1: 164723-164780 [-] |
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| Seed | ACCCCGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUCCGACUGGCUUCUAGGCGGCCGGAGUCUACCCCGCCAACCGGACAGGAAAGGCGUGAAGCGCUUCCAGUCCAGCUGGACGGGGACGAGGCAGGCCGAACCAGAGACACCCCACCGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCUCCGACUGGCUUCUAGG-- GGA A-- -| ACC A AAGGCGU CGGCC GUCU CCCCG CCA GGAC GGA \ GCCGG CGGA GGGGC GGU CCUG CCU G CAGCCACCCCACAGAGACCAA A-- GCA A^ CGA A UCGCGAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Oan-Mir-1362_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0007023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACCCCGCCAACCGGACAGGA -21
Get sequence
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| Star sequence | Oan-Mir-1362_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0007024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CAGUCCAGCUGGACGGGGACGA -60
Get sequence
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