| MirGeneDB ID | Oan-Novel-12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | OAN-NOVEL-12 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041743.1: 40940749-40940804 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-12) |
Novel-12
NC_041743.1: 40940749-40940804 [+]
Mir-30-P1d NC_041743.1: 40945688-40945750 [+] Mir-30-P2d NC_041743.1: 40947632-40947692 [+] |
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| Seed | GGGAACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGGGUACAAUACAAUAAGCUCCUUAUGGGCAGGGAACAUGUCUGCUAAUUGUUCGAUACAGCACAAUUAGCGGAGAUGUUCCCUGCCUAUAAUGAGUUUAUGGUCUAGUGGGGGAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGGGUACAAUACAAUAA--| C G UCGA GCUC UUAUGGGCAGGGAACAU UCUGCUAAUUGU U UGAG AAUAUCCGUCCCUUGUA AGGCGAUUAACA A GAGGGGGUGAUCUGGUAUU^ U G CGAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Oan-Novel-12_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGGAACAUGUCUGCUAAUUGU -22
Get sequence
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| Star sequence | Oan-Novel-12_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AAUUAGCGGAGAUGUUCCCUGC -56
Get sequence
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