| MirGeneDB ID | Obi-Mir-12526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12526 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Esc-Mir-12526-v1 Ovu-Mir-12526-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ419643: 483041-483101 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12526-v1) |
Mir-12526-v1
KQ419643: 483041-483101 [-]
Ensembl
Mir-12526-v2 KQ419643: 483042-483100 [-] Ensembl |
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| Variant | Obi-Mir-12526-v1 |
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| Seed | UUCCCGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGGUACUGAUGACAAUGAUGGCUUGGCAGACAGACCUUUUCAGAAGGGGAAAAAUUAGGUUUCUCCAUUUUUCCCGCUGAAAAAGCCUUCCUGCCAAGACUCCUACCCAGGUUGUCAACGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGGUACUGAUGACAAUGAU- -| AC ACC AA AUUAGG GG CUUGGCAG AG UUUUCAG GGGGAAAA U UC GAACCGUC UC AAAAGUC CCCUUUUU U AGCAACUGUUGGACCCAUCC A^ CU CGA G- ACCUCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Obi-Mir-12526-v1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGACCUUUUCAGAAGGGGAAAA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Obi-Mir-12526-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUUCCCGCUGAAAAAGCCUUCC -61
Get sequence
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| Variant | Obi-Mir-12526-v2 |
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| Seed | UUUCCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUACUGAUGACAAUGAUGGCUUGGCAGACAGACCUUUUCAGAAGGGGAAAAAUUAGGUUUCUCCAUUUUUCCCGCUGAAAAAGCCUUCCUGCCAAGACUCCUACCCAGGUUGUCAACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGUACUGAUGACAAUGAU- -| AC ACC AA AUUAGG GG CUUGGCAG AG UUUUCAG GGGGAAAA U UC GAACCGUC UC AAAAGUC CCCUUUUU U GCAACUGUUGGACCCAUCC A^ CU CGA G- ACCUCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Obi-Mir-12526-v2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGACCUUUUCAGAAGGGGAAAAA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Obi-Mir-12526-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUUUCCCGCUGAAAAAGCCUUC -59
Get sequence
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