| MirGeneDB ID | Ofu-Mir-1994-P10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1994 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tubeworm (Owenia fusiformis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ofu-Mir-1994-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cte-Mir-1994 Dgr-Mir-1994 Efe-Mir-1994 Llo-Mir-1994 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. fusiformis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_903813345.2_Owenia) |
CAIIXF020000001.1: 56578318-56578375 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1994-P10) |
Mir-1994-P9
CAIIXF020000001.1: 56576378-56576438 [+]
Mir-1994-P10 CAIIXF020000001.1: 56578318-56578375 [+] |
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| Seed | GAGACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCGGAGGAUUUCAAACUGCGUCAUGUUGUUCGGGACGACACUCUAUCUCGUUUUGUAUUAAAGCAAUGAGACAGUGUGUCCUCCCUCGUGGCGACGCUAAACUCAACCCGGGACACAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCGGAGGAUUUCAAACU----| AU UG UC C U A UUGUA GCGUC GU U GGGA GACAC CU UCUCGUU U CGCAG CG G CCCU CUGUG GA AGAGUAA U GACACAGGGCCCAACUCAAAU^ -- GU CU C U C CGAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ofu-Mir-1994-P10_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGACGACACUCUAUCUCGUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ofu-Mir-1994-P10_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UGAGACAGUGUGUCCUCCCUCG -58
Get sequence
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