| MirGeneDB ID | Pve-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Vernerds tusk shell (Pictodentalium vernedei) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pve-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Pve_genome_chr_only) |
Pve_Chr7: 269709983-269710042 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v2
Pve_Chr7: 269709983-269710042 [-]
Ensembl
Mir-67-v1 Pve_Chr7: 269709984-269710041 [-] Ensembl |
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| Variant | Pve-Mir-67-v2 |
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| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAUGAAUGUUUAGACUUUCAGUGUGUGCGUCCUUGUUCAGCGGUGUUGUGAUGCUAAGGAAGACAUCACAACCUGCUUGAAUGAGGACUUACGCCUGUCCUGGCUGCUUACACCGACAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCAUGAAUGUUUAGACUUU---| U C UG - U GCUAA CAG GUGUG GUCCU UUCA GCGG GUUGUGAU G GUC CGCAU CAGGA AAGU CGUC CAACACUA G AACAGCCACAUUCGUCGGUCCU^ - U GU U - CAGAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pve-Mir-67-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCUUGUUCAGCGGUGUUGUGAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pve-Mir-67-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACAACCUGCUUGAAUGAGGACU -60
Get sequence
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| Variant | Pve-Mir-67-v1 |
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| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUGAAUGUUUAGACUUUCAGUGUGUGCGUCCUUGUUCAGCGGUGUUGUGAUGCUAAGGAAGACAUCACAACCUGCUUGAAUGAGGACUUACGCCUGUCCUGGCUGCUUACACCGACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAUGAAUGUUUAGACUUU---| U C UG - U CUAA CAG GUGUG GUCCU UUCA GCGG GUUGUGAUG G GUC CGCAU CAGGA AAGU CGUC CAACACUAC G ACAGCCACAUUCGUCGGUCCU^ - U GU U - AGAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pve-Mir-67-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUUGUUCAGCGGUGUUGUGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pve-Mir-67-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UCACAACCUGCUUGAAUGAGGAC -58
Get sequence
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