| MirGeneDB ID | Sha-Mir-7303-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7303 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Sha-Mir-7303-P1-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7303-P2 Neu-Mir-7303-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (DEVIL_add) |
GL849772.1: 43147-43201 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7303-P2) |
Mir-430-P51
GL849772.1: 42803-42860 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7303-P2 GL849772.1: 43147-43201 [-] UCSC Ensembl Mir-1541 GL849772.1: 43949-44008 [-] UCSC Ensembl Mir-7304 GL849772.1: 44094-44152 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v1 GL849772.1: 44547-44605 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v2 GL849772.1: 44547-44605 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AGGCGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAACCUGGGGAAACUGGUCUAACCCAAUCACAUCCAAACUAGACGCACUCUCUGGUCCUAGACAGGCGUCUUCUUUGGGUGUGAUUGUGUGGGACAGAUGGCAUCAUUCAUGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGAACCUGGGGAAACUG--| A C CU A C UGG GUCU AC CAAUCACAUCCAAA AGACGC CU UC U CAGG UG GUUAGUGUGGGUUU UCUGCG GA AG C AGGUACUUACUACGGUAGA^ G U CU - C AUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Sha-Mir-7303-P2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACAUCCAAACUAGACGCACUCUC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Sha-Mir-7303-P2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- CAGGCGUCUUCUUUGGGUGUGA -55
Get sequence
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