| MirGeneDB ID | Aga-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aga-mir-92a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Aga-Mir-92-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-92-P3 Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o3 Bge-Mir-92-P3 Bla-Mir-92-o3 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P3 Dlo-Mir-92-P3 Dma-Mir-92-P3 Dme-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P3 Dpu-Mir-92-P3 Dsi-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P3 Esc-Mir-92 Gpa-Mir-92-P3 Gsp-Mir-92 Hme-Mir-92-P3 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 Tca-Mir-92-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 38578027-38578084 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P3) |
Mir-92-P3
NC_064601.1: 38578027-38578084 [+]
Ensembl
Mir-92-P4 NC_064601.1: 38592563-38592624 [+] Ensembl |
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| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUAGUCGAAUAAAAAUCAGGACUACGCGUCGGCCGGCUCAAGAGCAAAAUUGUGUUUCAUACUAAUAUUGCACUUGUCCCGGCCUAUGUGUGGUAAGGCCUGAAAAGCAUCAGUCUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACUAGUCGAAUAAAAAUCAGG--| C CU A A GUGUU ACUACGCGU GGCCGG CAAG GCAA AUU U UGGUGUGUA CCGGCC GUUC CGUU UAA C GUCUGACUACGAAAAGUCCGGAA^ U CU A A UCAUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aga-Mir-92-P3_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGCCGGCUCAAGAGCAAAAUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Aga-Mir-92-P3_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAUUGCACUUGUCCCGGCCUAU -58
Get sequence
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