| MirGeneDB ID | Bla-Mir-2072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2072 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | European lancelet (Branchiostoma lanceolatum) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bfl-Mir-2072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Branchiostoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Branchiostoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (BraLan2) |
Sc0000547: 18221-18276 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2072) |
Mir-4863
Sc0000547: 17835-17895 [+]
Ensembl
Mir-2072 Sc0000547: 18221-18276 [+] Ensembl |
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| Seed | GCAACAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUCUUGCCUAGAAGAGGGCCUUGUCUUGCUGCAACAUCACAGUGACCACAUAGGAGAGUCAAUGUGAGCACUGCGAUGUGGUAUUAAGAUCUGGCCAUGCCACACAGUUAAUCAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGUCUUGCCUAGAAGAG--| UU C A A AC AGGA GGCC GUCUUG UGC ACAUC CAGUG CACAU G CCGG UAGAAU AUG UGUAG GUCAC GUGUA A GACUAAUUGACACACCGUA^ UC U G C GA ACUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Bla-Mir-2072_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCAACAUCACAGUGACCACAU -22
Get sequence
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| Star sequence | Bla-Mir-2072_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- GUGAGCACUGCGAUGUGGUAUU -56
Get sequence
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