| MirGeneDB ID | Cja-Mir-3613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3613 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-3613 Cfa-Mir-3613 Cpo-Mir-3613 Dno-Mir-3613 Eca-Mir-3613 Ete-Mir-3613 Hsa-Mir-3613 Laf-Mir-3613 Mdo-Mir-3613 Mml-Mir-3613 Mmr-Mir-3613 Neu-Mir-3613 Ocu-Mir-3613 Pab-Mir-3613 Sha-Mir-3613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021915.1: 65267668-65267726 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUUGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCCGUAUAAUAAGAUGGUUGGGUUUGGAUUGUUGUACUUUUUUUUUUGUUCGUUGCAUUUUUAGGAACAAAAAAAAAAGCCCAACCCUUCACACCACUUCAUUCGCAUCUCAGGACCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGCCGUAUAAUAAGAUGGUUG--| U UU UA GUUGCA GGU UGGA GUUG CUUUUUUUUUUGUUC \ CCA ACUU CAAC GAAAAAAAAAACAAG U ACCAGGACUCUACGCUUACUUCA^ C CC CC GAUUUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cja-Mir-3613_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUUGUACUUUUUUUUUUGUUC -22
Get sequence
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| Star sequence | Cja-Mir-3613_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- ACAAAAAAAAAAGCCCAACCCU -59
Get sequence
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