| MirGeneDB ID | Cja-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-676 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-676 Cpo-Mir-676 Dno-Mir-676 Eca-Mir-676 Hsa-Mir-676 Laf-Mir-676 Mml-Mir-676 Mmr-Mir-676 Mmu-Mir-676 Ocu-Mir-676 Pab-Mir-676 Rno-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021937.1: 64195949-64196005 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CGUCCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCAUAUCAGAUCCUCACCUGAAUGCAUGACUCUUCAACCUCAGGACUUGCAGAAUUAGUGGAAUGCCGUCCUAAGGUUGUUGAGUUGUGCAUUUGUGGGCAUUUCAUCUCUAUGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCAUAUCAGAUCCUCA- -| UG UU C UU GAAUU CC UGAAUGCA ACUC CAACCU AGGAC GCA A GG GUUUACGU UGAG GUUGGA UCCUG CGU G AGGUAUCUCUACUUUACG U^ GU UU A C- AAGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cja-Mir-676_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCUUCAACCUCAGGACUUGCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cja-Mir-676_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCGUCCUAAGGUUGUUGAGUU -57
Get sequence
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