| MirGeneDB ID | Pab-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-676 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-676 Cja-Mir-676 Cpo-Mir-676 Dno-Mir-676 Eca-Mir-676 Hsa-Mir-676 Laf-Mir-676 Mml-Mir-676 Mmr-Mir-676 Mmu-Mir-676 Ocu-Mir-676 Rno-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054702.2: 74854169-74854225 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CGUCCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCAUAUCAGAUUCUCACCUGAACGCAUGACUCUUCAACCUCAGGACUUGCAGAAUUGAUGGAAUGCCGUCCUAAGGUUGUUGAGUUGUGCGUUUCUGGGCAUUUCAUCUCUAUGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCAUAUCAGAUUCUCA- U-| UG UU C UU GAAUU CC GAACGCA ACUC CAACCU AGGAC GCA G GG UUUGCGU UGAG GUUGGA UCCUG CGU A AGGUAUCUCUACUUUACG UC^ GU UU A C- AAGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pab-Mir-676_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCUUCAACCUCAGGACUUGCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Pab-Mir-676_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCGUCCUAAGGUUGUUGAGUU -57
Get sequence
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