| MirGeneDB ID | Dan-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-314 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dan-mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-314 Dmo-Mir-314 Dsi-Mir-314 Dya-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13337: 6019520-6019605 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-314) |
Mir-314
scaffold_13337: 6019520-6019605 [+]
Ensembl
Mir-956-v1 scaffold_13337: 6020256-6020365 [-] Ensembl Mir-956-v2 scaffold_13337: 6020256-6020365 [-] Ensembl |
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| Seed | AUUCGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUGACUGGGUUUUGGCCCGCACUCUUAUCGUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACCUAGUUGAGGAAAAAUCAGUUUGGAUUUUGUUACCUCUGGUAUUCGAGCCAAUAAGUUCGGCCACGAAUUCGCAUUUUAUCUUUUGCAUUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 UAUGACUGGGUUUUGGCCC AC-- UUA-| U G U AU UAGUUGAGGAAAAAUCAG GC UC UCG AACUUGU UGGCU CGA GUACC \ CG AG GGC UUGAAUA ACCGA GCU UAUGG U UUUACGUUUUCUAUUUUA- CUUA CACC^ - - - -- UCUCCAUUGUUUUAGGUU 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Mir-314_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACC -26
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Mir-314_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
65- UAUUCGAGCCAAUAAGUUCGG -86
Get sequence
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