| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-314 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-314 Dme-Mir-314 Dmo-Mir-314 Dya-Mir-314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3L: 11468004-11468091 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-314) |
Mir-314
3L: 11468004-11468091 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-956-v1 3L: 11468691-11468819 [-] UCSC Ensembl Mir-956-v2 3L: 11468691-11468819 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUUCGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUAGCAGUGUUUUGGCCCGCACUCUUAUCGUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACCUAGUUGAGGAAAAGUCCCGUGUCGGAUUUUGUUACCUCUGGUAUUCGAGCCAAUAAGUUCGGCCACGAAUUCGCAUUUUAUCUUUUUUUGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 UAUAGCAGUGUUUUGGCCC AC-- UUA-| U G U AU UAGUUGAGGAAAAGUCCCG GC UC UCG AACUUGU UGGCU CGA GUACC \ CG AG GGC UUGAAUA ACCGA GCU UAUGG U ACGUUUUUUUCUAUUUUA- CUUA CACC^ - - - -- UCUCCAUUGUUUUAGGCUG 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-314_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAACUUGUGUGGCUUCGAAUGUACC -26
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-314_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
67- UAUUCGAGCCAAUAAGUUCGG -88
Get sequence
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