| MirGeneDB ID | Dan-Mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-955 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-955 Dmo-Mir-955 Dsi-Mir-955 Dya-Mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13337: 7606454-7606515 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-955) |
Mir-282
scaffold_13337: 7556623-7556687 [+]
Ensembl
Mir-955 scaffold_13337: 7606454-7606515 [+] Ensembl |
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| Seed | AUCGUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGGAUGUUUUUUGAGAAGCUCAUCAGCUCCAUCGUGCAGAGGUUUGAGUGUCUAAUUUUUAACCAUUCGCAUUCAACCUUUGGACGGUAGAGAUGGUCAGUGAGAAAGCAACCUAUACAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGGAUGUUUUUUGAGAA--| C G C G U CUAAUUUU GCU AUCA CUC AUCGU CAGAGGUU GAGUGU \ UGA UGGU GAG UGGCA GUUUCCAA CUUACG U AGACAUAUCCAACGAAAGAG^ C A A G - CUUACCAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dan-Mir-955_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAUCGUGCAGAGGUUUGAGUGUC -23
Get sequence
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| Star sequence | Dan-Mir-955_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CAUUCAACCUUUGGACGGUAGA -62
Get sequence
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