| MirGeneDB ID | Dya-Mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-955 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-955 Dme-Mir-955 Dmo-Mir-955 Dsi-Mir-955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3L: 3844770-3844832 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-955) |
Mir-282
3L: 3795955-3796019 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-955 3L: 3844770-3844832 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUCGUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAUAAGUAAAGUAAACAGCUAAUCAACUCCAUCGUGCAGAAGUUUGAGUGUCCUGUGUGUUGCCUAAUCGCAUUCAAUUUCUGAACGGUAGAGAUGGUACGCUUAGAAACAACCUAAAAUGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAAUAAGUAAAGUAAAC--| UA A C G U CCUGUGUG AGC AUCA CUC AUCGU CAGAAGUU GAGUGU U UCG UGGU GAG UGGCA GUCUUUAA CUUACG U AGUAAAAUCCAACAAAGAU^ CA A A A - CUAAUCCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dya-Mir-955_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAUCGUGCAGAAGUUUGAGUGUC -23
Get sequence
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| Star sequence | Dya-Mir-955_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAUUCAAUUUCUGAACGGUAGA -63
Get sequence
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