| MirGeneDB ID | Dya-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-282 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dya-mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-282-P1 Aae-Mir-282-P2 Aga-Mir-282 Bge-Mir-282 Dan-Mir-282 Dma-Mir-282-v1 Dme-Mir-282 Dmo-Mir-282 Dpu-Mir-282 Dsi-Mir-282 Gpa-Mir-282 Hme-Mir-282 Tca-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3L: 3795955-3796019 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-282) |
Mir-282
3L: 3795955-3796019 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-955 3L: 3844770-3844832 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AGCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUAUCCGUUAUAUCAGUUUCCUUAUAAAUCUAGCCUCUACUAGGCUUUGUCUGUGCAUACGAAAGCCGAUCAGACAUAGCCUAUAAGAGGUUAGGUGUACCAAGGUGAAAAAUCAGCGAAAACGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAUCCGUUAUAUCAGUUU- AUAA-| AC U GUGCAUACG CCUU AUCUAGCCUCU UAGGCU UGUCU \ GGAA UGGAUUGGAGA AUCCGA ACAGA A GGCAAAAGCGACUAAAAAGU CCAUG^ AU U CUAGCCGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dya-Mir-282_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGCCUCUACUAGGCUUUGUCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Dya-Mir-282_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- ACAUAGCCUAUAAGAGGUUAGG -65
Get sequence
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