| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-3715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3715 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-3715-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. longicaudata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. longicaudata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087231.1: 8906823-8906880 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-3715-v2) |
Mir-3715-v1
NC_087231.1: 8906822-8906881 [+]
Ensembl
Mir-3715-v2 NC_087231.1: 8906823-8906880 [+] Ensembl |
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| Variant | Dlo-Mir-3715-v2 |
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| Seed | CGGUAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCGGUUCAAUGAUUUUUUGGGCUGCACUAUCGGUAAACAGUGUGUAAGACCUUGCAAUUGAAUUGGUAUUAUGCACGUUUACCAAGGGUGCACCUUGAAAUUAUCAACCCGUUGGUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCGGUUCAAUGAUUUU--|UG C AUC A G UUGCAA U GG UGCACU GGUAAAC GUGUGUAA ACC \ A UC ACGUGG CCAUUUG CACGUAUU UGG U GUGGUUGCCCAACUAUUAA^GU C GAA - A UUAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-3715-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGGUAAACAGUGUGUAAGACC -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dlo-Mir-3715-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAUUAUGCACGUUUACCAAGG -58
Get sequence
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| Variant | Dlo-Mir-3715-v1 |
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| Seed | UCGGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCGGUUCAAUGAUUUUUUGGGCUGCACUAUCGGUAAACAGUGUGUAAGACCUUGCAAUUGAAUUGGUAUUAUGCACGUUUACCAAGGGUGCACCUUGAAAUUAUCAACCCGUUGGUGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUUCGGUUCAAUGAUUU--| UG C AUC A G UUGCAA UU GG UGCACU GGUAAAC GUGUGUAA ACC \ AA UC ACGUGG CCAUUUG CACGUAUU UGG U UGUGGUUGCCCAACUAUUA^ GU C GAA - A UUAAGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-3715-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUCGGUAAACAGUGUGUAAGACC -23
Get sequence
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| Co-mature sequence | Dlo-Mir-3715-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UAUUAUGCACGUUUACCAAGGG -60
Get sequence
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