| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-67-P14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-67-P14-v1 Dlo-Mir-67-P15-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. longicaudata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087233.1: 4354631-4354710 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-P14-v3) |
Mir-67-P14-v1
NC_087233.1: 4354631-4354710 [+]
Ensembl
Mir-67-P14-v2 NC_087233.1: 4354631-4354710 [+] Ensembl Mir-67-P14-v3 NC_087233.1: 4354631-4354710 [+] Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant | Dlo-Mir-67-P14-v3 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAACCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGAAAAUUCAACGAUAGCGUACUUCGUUUACUCACUCAACCCGGGUGUGAUGCUUGUCCACAGUGACGUGGACUCCCUGUUGACCAUCACAACCUUUUUGAGUGAGCGAAUGCGGACGUUUGGUCAACAAGGAACAACUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGAAAAUUCAACGAUA---| A U UA CCC - UGCUUGUCCACAGUGAC GCGU CU CGUU CUCACUCAA GGGU GUGA G UGCA GG GUAA GAGUGAGUU UCCA CACU U UCAACAAGGAACAACUGGUU^ - C GC UU- A ACCAGUUGUCCCUCAGG . 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Dlo-Mir-67-P14-v3_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCCGGGUGUGA -21
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Dlo-Mir-67-P14-v3_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
59- ACAACCUUUUUGAGUGAGCGA -80
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant | Dlo-Mir-67-P14-v1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGAAAAUUCAACGAUAGCGUACUUCGUUUACUCACUCAACCCGGGUGUGAUGCUUGUCCACAGUGACGUGGACUCCCUGUUGACCAUCACAACCUUUUUGAGUGAGCGAAUGCGGACGUUUGGUCAACAAGGAACAACUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGAAAAUUCAACGAUA---| A U UA CCC - CUUGUCCACAGUGAC GCGU CU CGUU CUCACUCAA GGGU GUGAUG G UGCA GG GUAA GAGUGAGUU UCCA CACUAC U UCAACAAGGAACAACUGGUU^ - C GC UU- A CAGUUGUCCCUCAGG . 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Dlo-Mir-67-P14-v1_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCCGGGUGUGAUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Dlo-Mir-67-P14-v1_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
57- UCACAACCUUUUUGAGUGAGCGA -80
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Variant | Dlo-Mir-67-P14-v2 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGAAAAUUCAACGAUAGCGUACUUCGUUUACUCACUCAACCCGGGUGUGAUGCUUGUCCACAGUGACGUGGACUCCCUGUUGACCAUCACAACCUUUUUGAGUGAGCGAAUGCGGACGUUUGGUCAACAAGGAACAACUGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGAAAAUUCAACGAUA---| A U UA CCC - GCUUGUCCACAGUGAC GCGU CU CGUU CUCACUCAA GGGU GUGAU G UGCA GG GUAA GAGUGAGUU UCCA CACUA U UCAACAAGGAACAACUGGUU^ - C GC UU- A CCAGUUGUCCCUCAGG . 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Dlo-Mir-67-P14-v2_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCCGGGUGUGAU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Dlo-Mir-67-P14-v2_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
58- CACAACCUUUUUGAGUGAGCGA -80
Get sequence
|
