| MirGeneDB ID | Dme-Mir-970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-970 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-970 Aga-Mir-970 Dan-Mir-970 Dmo-Mir-970 Dsi-Mir-970 Dya-Mir-970 Gpa-Mir-970 Hme-Mir-970 Tca-Mir-970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Aparaglossata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Aparaglossata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 12636352-12636416 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAUAAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGUGCCCAUAAUCGAAAGGCAUCUGUUGCAGCUAGCGGGUGUUUUAUUUGGUAGCUGUAAUGAUUUGAAUCUAUCAUAAGACACACGCGGCUAUAACCGUUGUCUAAGAGCUUCAAAAUCGAUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGUGCCCAUAAUCGAA--| UCU C A G UU GCUGUAAU AGGCA GUUG AGCU GCG GUGUUUUA UGGUA G UCUGU CAAU UCGG CGC CACAGAAU ACUAU A AUAGCUAAAACUUCGAGAA^ UGC A - A -- CUAAGUUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-970_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUAGCGGGUGUUUUAUUUGGUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-970_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- UCAUAAGACACACGCGGCUAU -65
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005486 TargetScanFly: dme-miR-970 |
