| MirGeneDB ID | Dmo-Mir-92-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dmo-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P4 Dmo-Mir-92-P6 Dmo-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o5 Bla-Mir-92-o5 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P5 Dme-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P5 Dya-Mir-92-P5 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6496: 9090312-9090376 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P5) |
Mir-92-P5
scaffold_6496: 9090312-9090376 [-]
Ensembl
Mir-92-P6 scaffold_6496: 9090464-9090534 [-] Ensembl Mir-92-P8 scaffold_6496: 9090674-9090732 [-] Ensembl |
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| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUAAAUAUCGUUUAAAUGUAUCCAUUUUUAGGCCGUGCUAUGUGACAAUAUGUAUUUAAAUUGUAUUUAUCAUAUUGCACAUCUCCCGGCCUACAAGUGUAAAUGCACAAUUCAACUAUGUACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUAAAUAUCGUUUAAAU C--| U UGCU A UAUUUAAA GUAU CAUUU UAGGCCG AUGUG CAAUAUG U CGUA GUGAA AUCCGGC UACAC GUUAUAC U ACAUGUAUCAACUUAACA AAU^ C CCUC - UAUUUAUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dmo-Mir-92-P5_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGCCGUGCUAUGUGACAAUAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dmo-Mir-92-P5_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UAUUGCACAUCUCCCGGCCUAC -65
Get sequence
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