| MirGeneDB ID | Dno-Mir-296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-296 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-296 Cfa-Mir-296 Cja-Mir-296 Cpo-Mir-296 Eca-Mir-296 Hsa-Mir-296 Laf-Mir-296 Mml-Mir-296 Mmr-Mir-296 Mmu-Mir-296 Pab-Mir-296 Rno-Mir-296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568283: 2444403-2444457 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGGUUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGAUGACGAUGAAGAGAAGGACCCUUCCGGAGGGCCCCCCUCAACCCUGUUGUGCUUGAUUCAGAGGGUUGGGUGGAGGCUUUCCUGAAGGGCUCUGAGAAGUCGCUGCCUCUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGAUGACGAUGAAGAGA-- GA C C -| GUUGUGC AG CCCUUC GGAGGGCC CC CUCAACCCU U UC GGGAAG CCUUUCGG GG GGGUUGGGA U GGUCUCCGUCGCUGAAGAG UC U A U^ GACUUAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-296_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGGCCCCCCUCAACCCUGU -20
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-296_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AGGGUUGGGUGGAGGCUUUCC -55
Get sequence
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