| MirGeneDB ID | Dya-Mir-303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-303 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-303 Dsi-Mir-303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 4177759-4177818 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-303) |
Mir-303
X: 4177759-4177818 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-9682 X: 4178218-4178276 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUUUACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGCAUCAGGAACUCAAAUAAUCUGCCUUGCUUAGAAUUUUAAGAGCAAAAAGUUUGUUUACAAAAACUAUUUACCCCUAAAAUUCUAAUCUAGUCAGCAUUAUUUCGCAUCGUGGAAUUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGCAUCAGGAACUCAAA- -| C UGC AGAGC A UUGUU UAAU CUG CU UUAGAAUUUUA AAA AGU U AUUA GAC GA AAUCUUAAAAU UUU UCA A AUUAAGGUGCUACGCUUU C^ U UCU CCCCA A AAAAC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dya-Mir-303_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAGAAUUUUAAGAGCAAAAAGU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dya-Mir-303_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAUUUACCCCUAAAAUUCUAAUC -60
Get sequence
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