| MirGeneDB ID | Dya-Mir-9682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-9682 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dya-mir-9682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. yakuba | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. yakuba | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 4178218-4178276 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-9682) |
Mir-303
X: 4177759-4177818 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-9682 X: 4178218-4178276 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UCACUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUACAAGUGAUUAUUGAUAUCAAAAUGUCCCGGGGAAGUUACCUGGUGUAUUGUUUUUAAUCAACCAAUCACUGGAUAGCUUUCCUAGAACAAAAUGACAGUGCCUUUACAUAAACAGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUACAAGUGAUUAUUGAUA--| AAA CCC C UG U UUUUU UCA UGU GGGGAAGUUA C GUG AUUG A AGU ACA UCCUUUCGAU G CAC UAAC A UGACAAAUACAUUUCCGUGAC^ AAA AGA A GU - CAACU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dya-Mir-9682_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0039172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGGAAGUUACCUGGUGUAUUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dya-Mir-9682_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0039173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUCACUGGAUAGCUUUCCUAGA -59
Get sequence
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