| MirGeneDB ID | Ete-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1912 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1912 Cfa-Mir-1912 Cja-Mir-1912 Cpo-Mir-1912 Eca-Mir-1912 Hsa-Mir-1912 Laf-Mir-1912 Mml-Mir-1912 Mmr-Mir-1912 Mmu-Mir-1912 Ocu-Mir-1912 Pab-Mir-1912 Rno-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980336: 11900400-11900454 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1912) |
Mir-1912
JH980336: 11900400-11900454 [+]
UCSC
Mir-1264 JH980336: 11901675-11901737 [+] UCSC |
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| Seed | ACCCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUCACAACUGGACUUAGCUCUAGGAUGUACUCAUUGCAUGGGCUGUGUAUAUUUUUAUUUAAUACCCAGAGCAUGCAUUGUGGACAUAAUAGAGAUUGAAAGACAGCCAGAAGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UAUCACAACUGGACUUAG--| GG ACU U GG U AUUUU CUCUA AUGU CA UGCAUG CUG GUAU \ GAGAU UACA GU ACGUAC GAC CAUA U GGAAGACCGACAGAAAGUUA^ AA GGU U GA C AUUUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ete-Mir-1912_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCAUUGCAUGGGCUGUGUAUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ete-Mir-1912_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- UACCCAGAGCAUGCAUUGUGGA -55
Get sequence
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