| MirGeneDB ID | Ete-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ete-Mir-362-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-362-P4 Cfa-Mir-362-P4 Cja-Mir-362-P4 Cpo-Mir-362-P4 Dno-Mir-362-P4 Eca-Mir-362-P4 Hsa-Mir-362-P4 Laf-Mir-362-P4 Mml-Mir-362-P4 Mmr-Mir-362-P4 Mmu-Mir-362-P4 Ocu-Mir-362-P4 Pab-Mir-362-P4 Rno-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980365: 3859828-3859886 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P4) |
Mir-362-P6
JH980365: 3855392-3855450 [-]
UCSC
Mir-188-P3 JH980365: 3855815-3855873 [-] UCSC Mir-362-P4 JH980365: 3859828-3859886 [-] UCSC |
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| Seed | AUCCUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCUGAGCCUUCUUGUCUGCUCCCCCUCUCUAAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGUGUUGUUUCAAUGCAACACACCUAUUCAAGGAUUCAAAGAGGCUGAGCCUUGUCUUCACGUAGAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCUGAGCCUUCUUGUCU- CC CU-| ACC A- GUUGU GCUC CCUCU AAUCCUUGGA UAGGUGUG GU \ CGAG GGAGA UUAGGAACUU AUCCACAC CG U GAAGAUGCACUUCUGUUC UC AAC^ --- AA UAACU 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ete-Mir-362-P4_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGU -24
Get sequence
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| Co-mature sequence | Ete-Mir-362-P4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AACACACCUAUUCAAGGAUUCA -59
Get sequence
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