| MirGeneDB ID | Laf-Mir-384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-384 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-384 Eca-Mir-384 Mmr-Mir-384 Mmu-Mir-384 Ocu-Mir-384 Rno-Mir-384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010051.1: 24687933-24687995 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-384) |
Mir-325
GL010051.1: 24640232-24640291 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-384 GL010051.1: 24687933-24687995 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | GUAAACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCUUACAGGCAGAAUGUUAAAUCAGGAAUUGUAAACAAUUUCUAGGCAAUGUGUAUAAUGUUUAUAAGUCAUUCCUAGAAAUUGUUCACAAUGCCUGUAACAUAUAUGCAACUAGCAAGAUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACCUUACAGGCAGAAUGUUAAAU--| A A C UGUAUAAU CAGG AUUGU AACAAUUUCUAGG AAUG G GUCC UAACA UUGUUAAAGAUCC UUAC U GUAGAACGAUCAACGUAUAUACAAU^ G C - UGAAUAUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Laf-Mir-384_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUAAACAAUUUCUAGGCAAUGU -23
Get sequence
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| Star sequence | Laf-Mir-384_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AUUCCUAGAAAUUGUUCACAAU -63
Get sequence
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