| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-384 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-384 Eca-Mir-384 Laf-Mir-384 Mmu-Mir-384 Ocu-Mir-384 Rno-Mir-384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 7304110-7304172 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-384) |
Mir-384
CM007693.1: 7304110-7304172 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-325 CM007693.1: 7342116-7342175 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | GUAAACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGUUACAGGUAGAAUGUUAAAUCAGGAAUUGUAAACAAUUCCUAGGCAAUGUGUAUAAUGUUUGUAAGUCAUUCCUAGAAAUUGUUCACAAUGCCUGUAACAUAUAUGCAACAAGCAAGAUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUGUUACAGGUAGAAUGUUAAAU--| A A C C UGUAUAAU CAGG AUUGU AACAAUU CUAGG AAUG G GUCC UAACA UUGUUAA GAUCC UUAC U GUAGAACGAACAACGUAUAUACAAU^ G C A - UGAAUGUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-384_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUAAACAAUUCCUAGGCAAUGU -23
Get sequence
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| Co-mature sequence | Mmr-Mir-384_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AUUCCUAGAAAUUGUUCACAAU -63
Get sequence
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