| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-325 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-325 Eca-Mir-325 Hsa-Mir-325 Laf-Mir-325 Mdo-Mir-325 Mml-Mir-325 Mmu-Mir-325 Ocu-Mir-325 Pab-Mir-325 Rno-Mir-325 Sha-Mir-325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 7342116-7342175 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-325) |
Mir-384
CM007693.1: 7304110-7304172 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-325 CM007693.1: 7342116-7342175 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUAGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCACACAGAGCUGAUACAGUACUUGGUUCCUAGUAGGUGUUCAGUAAGUGUUUGUGACAUAAUUCGUUUAUUGAGCACCUCCUAUCAAUCAAGCACUGUGCUAGGCUCUGGGACCACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUUCACACAGAGCUGAU--| A CC U UUUGUG ACAGU CUUGGUU UAG AGGUGUUCAGUAAGUG A UGUCA GAACUAA AUC UCCACGAGUUAUUUGC C ACACCAGGGUCUCGGAUCG^ C CU C UUAAUA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-325_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUAGUAGGUGUUCAGUAAGUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-325_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUUAUUGAGCACCUCCUAUCAA -60
Get sequence
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