| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-325 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-325 Eca-Mir-325 Hsa-Mir-325 Laf-Mir-325 Mdo-Mir-325 Mml-Mir-325 Mmr-Mir-325 Ocu-Mir-325 Pab-Mir-325 Rno-Mir-325 Sha-Mir-325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 105379105-105379164 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-325) |
Mir-384
chrX: 105344292-105344354 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-325 chrX: 105379105-105379164 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUAGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCUAACAGAGCCGAUAUAGUGCUUGGUUCCUAGUAGGUGCUCAGUAAGUGUUUGUGACAUAAUUCGUUUAUUGAGCACCUCCUAUCAAUCAAGCACUGUGCUAGGCUCUGGGGCCACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUUCUAACAGAGCCGAU--| CC U UUUGUG AUAGUGCUUGGUU UAG AGGUGCUCAGUAAGUG A UGUCACGAACUAA AUC UCCACGAGUUAUUUGC C ACACCGGGGUCUCGGAUCG^ CU C UUAAUA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-325_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUAGUAGGUGCUCAGUAAGUG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000558 TargetScanVert: mmu-miR-325-5p miRDB: MIMAT0000558 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-325_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUUAUUGAGCACCUCCUAUCAA -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004640 TargetScanVert: mmu-miR-325-3p miRDB: MIMAT0004640 |
