| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7304 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mdo-mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Neu-Mir-7304 Sha-Mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
4: 400891594-400891652 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7304) |
Mir-430-P52
4: 400890413-400890471 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P51 4: 400890701-400890759 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P2 4: 400890972-400891034 [-] UCSC Ensembl Mir-1541 4: 400891450-400891510 [-] UCSC Ensembl Mir-7304 4: 400891594-400891652 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v1 4: 400892027-400892085 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v2 4: 400892027-400892085 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AUGGGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAACCUGUGCCCUUCCACUCAACUGCCUUAUUCAUACCACACUCUCAUUCUUAUCUGUGUCUAGAAUGGGGUGUCCUGGUGUGAAUGAUUCUGUUGAGAAUUCCUCGGCCAACCCACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAACCUGUGCCCUUCCA-- UGCC ---| U UAUCU CUCAAC UUAUUCAUACC ACACUC CAUUCU \ GAGUUG AGUAAGUGUGG UGUGGG GUAAGA G ACACCCAACCGGCUCCUUAA UCUU UCC^ - UCUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mdo-Mir-7304_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0028602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUCAUACCACACUCUCAUUCU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7304-5p |
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| Mature sequence | Mdo-Mir-7304_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0028603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- AAUGGGGUGUCCUGGUGUGAAUGA -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7304-3p |
