| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1264 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1264 Cfa-Mir-1264 Cja-Mir-1264 Cpo-Mir-1264 Eca-Mir-1264 Ete-Mir-1264 Hsa-Mir-1264 Laf-Mir-1264 Mml-Mir-1264 Mmu-Mir-1264 Ocu-Mir-1264 Pab-Mir-1264 Rno-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 42598756-42598818 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1264) |
Mir-1912
CM007693.1: 42597656-42597710 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1264 CM007693.1: 42598756-42598818 [+] UCSC Ensembl Mir-1298 CM007693.1: 42645967-42646040 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAGUCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUUGUGUUUCUUCAUGCCUGGCAUAUAGCAGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUUGAAAGAAUAAAUAAACCAACAAGUCUUAUUUGAGCACCUGUUAUGUGGAGGAUAAAAAACUCCGACCCAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUUGUGUUUCUUCAUG---| GG C - U GAAAGAAU CCU CAUAUAGCAGGU CUCAA UAAG AUUUGUU \ GGA GUGUAUUGUCCA GAGUU AUUC UGAACAA A AGACCCAGCCUCAAAAAAUA^ G- C U - CCAAAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-1264_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-1264_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAGUCUUAUUUGAGCACCUGU -63
Get sequence
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