| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-224 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-224 Cfa-Mir-224 Cja-Mir-224 Cpo-Mir-224 Eca-Mir-224 Ete-Mir-224 Hsa-Mir-224 Laf-Mir-224 Mml-Mir-224 Mmu-Mir-224 Ocu-Mir-224 Pab-Mir-224 Rno-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 72790929-72790997 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-224) |
Mir-224
CM007693.1: 72790929-72790997 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-452-v1 CM007693.1: 72791988-72792051 [-] UCSC Ensembl Mir-452-v2 CM007693.1: 72791992-72792048 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAGUCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACAGAAAAGACAAACGCCUAGGGGCUUUCAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAGUAGAUGGUUGUUCAUUGUUUCAAAAUGGUGCCCUAGUGACUACAAAGCCCCAGAGCCAGCAUCAUCACCAAAGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGACAGAAAAGACAAAC-- -| A CA U U AGUAGAUGGUU GC CU GGGGCUUU AGUCACUAG GGU CCGUUU G CG GA CCCCGAAA UCAGUGAUC CCG GGUAAA U ACGAAACCACUACUACGAC A^ - CA - U ACUUUGUUACU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-224_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAG -24
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-224_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
46- AAAUGGUGCCCUAGUGACUACAA -69
Get sequence
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