| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-653 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-653 Cfa-Mir-653 Cja-Mir-653 Cpo-Mir-653 Dno-Mir-653 Eca-Mir-653 Hsa-Mir-653 Mml-Mir-653 Mmu-Mir-653 Ocu-Mir-653 Pab-Mir-653 Rno-Mir-653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007671.1: 58938858-58938916 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-653) |
Mir-653
CM007671.1: 58938858-58938916 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-489 CM007671.1: 58939901-58939963 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGAAACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGGAGGUUCUAAUUUCUCAUUCCUUCAGUGUUGAAACACUCUCUAGUGAACCAGGCUUCAAACGAAAUUCACUGGAGUUUGUUUCAAUAUUGCAAGAAUGGUAAGAUUGAAGCUACUGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGGAGGUUCUAAUUUCU--| CUU CU CCAGGCUU CAUUC CAGUGUUGAAACA CUCUAGUGAA \ GUAAG GUUAUAACUUUGU GAGGUCACUU C UGUCAUCGAAGUUAGAAUG^ AAC UU AAAGCAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-653_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUGAAACACUCUCUAGUGAACC -22
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-653_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUCACUGGAGUUUGUUUCAAUA -59
Get sequence
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