| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-430-P5b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-292a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-430-P1 Mmu-Mir-430-P2 Mmu-Mir-430-P3 Mmu-Mir-430-P4 Mmu-Mir-430-P5a Mmu-Mir-430-P5c Mmu-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P7a Mmu-Mir-430-P7b Mmu-Mir-430-P7c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-430-P5 Cja-Mir-430-P5 Cpo-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P5 Eca-Mir-430-P5 Ete-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P5 Laf-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P5 Ocu-Mir-430-P5 Pab-Mir-430-P5 Rno-Mir-430-P5b Xtr-Mir-430-o5b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 3219200-3219261 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P5b) |
Mir-430-P5a
chr7: 3218639-3218697 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P7a chr7: 3218932-3218989 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5b chr7: 3219200-3219261 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7b chr7: 3219494-3219550 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5c chr7: 3220356-3220411 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7c chr7: 3220655-3220712 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr7: 3220779-3220837 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAGUGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUUCUUAAGCUUGACCUCCAGCCUGUGAUACUCAAACUGGGGGCUCUUUUGGAUUUUCAUCGGAAGAAAAGUGCCGCCAGGUUUUGAGUGUCACCGGUUGAGAACUCAAAACGGCUAAGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGUUCUUAAGCUUGACC- - U --| G U GGAUUUU UC CAGCC GUGAUACUCAAA CUGG GGC CUUUU C AG GUUGG CACUGUGAGUUU GACC CCG GAAAA A AAGAAUCGGCAAAACUCA A C UG^ G U GAAGGCU 120 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-430-P5b_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0000369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCAAACUGGGGGCUCUUUUG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000369 TargetScanVert: mmu-miR-292a-5p miRDB: MIMAT0000369 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-430-P5b_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAAGUGCCGCCAGGUUUUGAGUGU -62
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000370 TargetScanVert: mmu-miR-292a-3p miRDB: MIMAT0000370 |
