| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-452 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-452-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Laf-Mir-452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 72262236-72262292 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-452-v2) |
Mir-224
chrX: 72261036-72261105 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-452-v1 chrX: 72262235-72262295 [-] UCSC Ensembl Mir-452-v2 chrX: 72262236-72262292 [-] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mmu-Mir-452-v2 |
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| Seed | GUUUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUCUCUUAUAUAUGCUAAGCAGUUACAACUGUUUGCAGAGGAAACUGAGACUUUAUAACUAUGUCUCAGUCUCAUCUGCAAAGAGGUAAGUGCUUUGCCAAGCCCCUUGAAGAAUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCUCUCUUAUAUAUGCU----| G AA G G A UUUAU AAGCA UUAC CU UUUGCAGA GA ACUGAGAC \ UUCGU AAUG GA AAACGUCU CU UGACUCUG A GUAAGAAGUUCCCCGAACCGU^ G -- G A C UAUCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-452-v2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0001637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0001637 miRDB: MIMAT0001637 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-452-v2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CUCAGUCUCAUCUGCAAAGAGG -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-452-3p miRDB: MIMAT0017194 |
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| Variant | Mmu-Mir-452-v1 |
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| Seed | ACUGUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUCCUCUCUUAUAUAUGCUAAGCAGUUACAACUGUUUGCAGAGGAAACUGAGACUUUAUAACUAUGUCUCAGUCUCAUCUGCAAAGAGGUAAGUGCUUUGCCAAGCCCCUUGAAGAAUGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACUCCUCUCUUAUAUAU--| U G AA G G A CUUUAU GC AAGCA UUAC CU UUUGCAGA GA ACUGAGA \ CG UUCGU AAUG GA AAACGUCU CU UGACUCU A GGUAAGAAGUUCCCCGAAC^ U G -- G A C GUAUCA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-452-v1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0001637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACUGUUUGCAGAGGAAACUGAGA -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0001637 miRDB: MIMAT0001637 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-452-v1_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCAGUCUCAUCUGCAAAGAGGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-452-3p miRDB: MIMAT0017194 |
