| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-574 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-574 Cfa-Mir-574 Cja-Mir-574 Cpo-Mir-574 Dno-Mir-574 Eca-Mir-574 Ete-Mir-574 Hsa-Mir-574 Laf-Mir-574 Mml-Mir-574 Mmr-Mir-574 Ocu-Mir-574 Pab-Mir-574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr5: 64970328-64970385 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACGCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGCCGAGGGCCCUGCGUGGGUGCGGGCGUGUGAGUGUGUGUGUGUGAGUGUGUGUCGCUCCAAGUCCACGCUCAUGCACACACCCACACGCCCGCACGCCCGGUCUGCACCCUCGUCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGCCGAGGGCCCUGCGU- -| AGU UGUCGC GG GUGCGGGCGUGUG GUGUGUGUGUGAGUGUG U CC CACGCCCGCACAC CACACACGUACUCGCAC C CCUGCUCCCACGUCUGGC G^ C-- CUGAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-574_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGUGUGUGUGUGUGAGUGUGUG -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004893 TargetScanVert: mmu-miR-574-5p miRDB: MIMAT0004893 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-574_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004894 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CACGCUCAUGCACACACCCACA -58
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004894 TargetScanVert: mmu-miR-574-3p miRDB: MIMAT0004894 |
