| MirGeneDB ID | Mom-Mir-92-o117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Mossy chiton (Mopalia muscosa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mom-Mir-92-o114 Mom-Mir-92-o115 Mom-Mir-92-o116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-92 Cel-Mir-92 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | A. granulata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_031763545.1_ASM3176354v1_genomic_Mom) |
JARFOD010081680.1: 2925-2980 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-o117) |
Mir-92-o114
JARFOD010081680.1: 722-779 [-]
Ensembl
Mir-92-o117 JARFOD010081680.1: 2925-2980 [-] Ensembl Mir-92-o116 JARFOD010081680.1: 3508-3567 [-] Ensembl Mir-92-o115 JARFOD010081680.1: 3825-3884 [-] Ensembl |
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| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAUAACGACGACAGAAGCCGUGUUUGUGACGGGCGUGAAUUGUGCAACUUGCUAGCUAUGGACAAAUUGCACUUUUCCCGGCCUGCCAUGAACACGGACAGCUCUUCUGGGAAGCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAUAACGACGACAGAAG-- UG A -| U UU C CUAGC CCGUGUU UG CGGG CG GAA GUGCAA UUG \ GGCACAA AC GUCC GC CUU CACGUU AAC U CCGAAGGGUCUUCUCGACA GU C G^ C UU A AGGUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | It is not clear either from phylogenetic or syntenic information how many Mir-92 genes were present in the last common ancestor of bilaterians and how the vertebrate Mir-92s relate to the invertebrate Mir-92s and thus these multiple paralogues in invertebrates are classified here as oMomans pending additional data. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mom-Mir-92-o117_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGCGUGAAUUGUGCAACUUG -21
Get sequence
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| Mature sequence | Mom-Mir-92-o117_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AAUUGCACUUUUCCCGGCCUGC -56
Get sequence
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