| MirGeneDB ID | Mun-Mir-458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-458 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-458 Ami-Mir-458 Cli-Mir-458 Cli-Mir-458-as Cpi-Mir-458 Dre-Mir-458 Gga-Mir-458 Gga-Mir-458-as Gja-Mir-458 Gmo-Mir-458 Lch-Mir-458 Loc-Mir-458 Mal-Mir-458 Oan-Mir-458 Pbv-Mir-458 Spt-Mir-458 Tgu-Mir-458 Tni-Mir-458 Xla-Mir-458-P1 Xla-Mir-458-P2 Xtr-Mir-458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594639.1: 181940700-181940757 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACCCUGCUGUAUGAGAGGUGCCGAUGGCAGCGCCAUUUUCAGAGCUAUAAACAGGAUCAUUGUCAUAGCUCUUUGAAUGGUACUGCCCUAUGCACUGAAAAAUCAGCACGCCGUCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGACCCUGCUGUAUGAGA--| CGAU CG UC AAACAGG GGUGC GGCAG CCAUUU AGAGCUAU A UCACG CCGUC GGUAAG UCUCGAUA U CCUGCCGCACGACUAAAAAG^ UAUC AU UU CUGUUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mun-Mir-458_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCGCCAUUUUCAGAGCUAUAA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Mun-Mir-458_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AUAGCUCUUUGAAUGGUACUGC -58
Get sequence
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