| MirGeneDB ID | Neu-Novel-7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | NEU-NOVEL-7 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051814.1: 55852830-55852887 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-7) |
Novel-7
CM051814.1: 55852830-55852887 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-12473 CM051814.1: 55858228-55858287 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UAUUAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUAUCCUCAGCUCUUAGCACAGUGGCUGGCACGUAGUAGACACUUAAUAAGUGUUUAUUGAUUGAUUUAUUAAGCGCUUACUAUGUGCCAGGUGCUGUACACUCCGCUCAGCGUGGAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUAUCCUCAGCUCUUAGC--| G ACA GUUUA ACAGUG CUGGCACGUAGUAG CUUAAUAAGU U UGUCGU GACCGUGUAUCAUU GAAUUAUUUA U UAGGUGCGACUCGCCUCACA^ G CGC GUUAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Novel-7_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGUAGUAGACACUUAAUAAGU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Novel-7_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUAUUAAGCGCUUACUAUGUGC -58
Get sequence
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