| MirGeneDB ID | Obi-Mir-12511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12511 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Esc-Mir-12511 Ovu-Mir-12511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ419141: 202251-202313 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12511) |
Mir-12508
KQ419141: 196735-196794 [+]
Ensembl
Mir-12511 KQ419141: 202251-202313 [+] Ensembl |
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| Seed | CCACGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAAAAUUGAGAAGAAACAGGCAAUUAGUAACUGGGUUUUCACUGAUGUCACGAACUAUUUCAAAUAUAUGACCACGGUGUAUAAUUCAGUAACUAGUAGCUUGUCUUACGACACUAAUAUUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAAAAUUGAGAAGAAA-- A A UU-| AU CGAACUAU CAGGC AUUAGU ACUGGGUU CACUG GUCA U GUUCG UGAUCA UGACUUAA GUGGC CAGU U AUUAUAAUCACAGCAUUCU A A UAU^ AC AUAUAAAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Obi-Mir-12511_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUGGGUUUUCACUGAUGUCA -21
Get sequence
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| Mature sequence | Obi-Mir-12511_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- ACCACGGUGUAUAAUUCAGUAA -63
Get sequence
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