| MirGeneDB ID | Pca-Novel-3-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | PCA-NOVEL-3 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Penis worm (Priapulus caudatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | P. caudatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | P. caudatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Priapulus_caudatus_gca000485595v2) |
KQ715186.1: 93118-93177 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-3-P2) |
Novel-3-P2
KQ715186.1: 93118-93177 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-67 KQ715186.1: 93487-93547 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUUUCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AACCACAGAGCUGUAUUCGGUCGCGUGGUUACUUUCUCGGGAGUUUGUUGUGUCCUGUUUACACCACCACAACCUCCCAUGAGGAAGCGGCUAUCGGCCACACUAUCAGCUGCACGCACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AACCACAGAGCUGUAUUC--- C UA --| U U UCCUG GGUCG GUGGU CUUUCUC GGGAG UUGU GUG U CCGGC UAUCG GAAGGAG CCCUC AACA CAC U GCACGCACGUCGACUAUCACA - GC UA^ C C CACAU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pca-Novel-3-P2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUUUCUCGGGAGUUUGUUGUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Pca-Novel-3-P2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCACAACCUCCCAUGAGGAAGCGG -60
Get sequence
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