| MirGeneDB ID | Sha-Mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7332 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7332 Neu-Mir-7332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (DEVIL_add) |
GL841586.1: 3883819-3883881 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7332) |
Mir-12380
GL841586.1: 3856147-3856202 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7332 GL841586.1: 3883819-3883881 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUGAAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUGACCUUGGAAAUGCCAGCAGUGUGGACCAAUAGCCUGGAUGAUUCAGAUGAAAGAAUCCACUUGGCCUCCUGAAUCAACUGACUGUUGGUCUGCAUUAGCUGAAGUCAACGGAAAAUGGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUGACCUUGGAAAUGC- -| UG CC A AUGAAAGAAU CAGC AGUG GACCAAUAG UGG UGAUUCAG C GUCG UUAC CUGGUUGUC GUC ACUAAGUC C CGGUAAAAGGCAACUGAA A^ GU A- A CUCCGGUUCA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Sha-Mir-7332_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAUAGCCUGGAUGAUUCAGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Sha-Mir-7332_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CCUGAAUCAACUGACUGUUGGU -63
Get sequence
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