| MirGeneDB ID | Tca-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Red flour beetle (Tribolium castaneum) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | tca-mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Tca-Mir-276-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-276-P1 Aae-Mir-276-P2 Aga-Mir-276-P1 Aga-Mir-276-P2 Bge-Mir-276 Csc-Mir-276-P10 Csc-Mir-276-P11a Csc-Mir-276-P11b Dan-Mir-276-P1 Dan-Mir-276-P2 Dlo-Mir-276 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P1 Dme-Mir-276-P2 Dmo-Mir-276-P1 Dmo-Mir-276-P2 Dpu-Mir-276 Dsi-Mir-276-P1 Dsi-Mir-276-P2 Dya-Mir-276-P1 Dya-Mir-276-P2 Gpa-Mir-276-P1 Gpa-Mir-276-P2 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Lpo-Mir-276-P3 Lpo-Mir-276-P4 Lpo-Mir-276-P5 Lpo-Mir-276-P6 Lpo-Mir-276-P7 Lpo-Mir-276-P8 Lpo-Mir-276-P9 Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tcas5.2) |
LG3: 12483938-12483995 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-276) |
Mir-276
LG3: 12483938-12483995 [-]
Ensembl
Mir-276-as LG3: 12483940-12483997 [+] Ensembl |
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| Seed | AGGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCGGAACGGCGCUCUUUUUGGUAGACCACUAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUGAUUUUUCGGCUGUAGGAACUUCAUACCGUGCUCUUGGAUUUACCGACCAUCAACGCACACACCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCGGAACGGCGCUCUUU- -| CU A AG UGAUU UUGGUAGA CCA AGCG GGUAU AGUUCCUACG U AGCCAUUU GGU UCGU CCAUA UCAAGGAUGU U ACCACACACGCAACUACC A^ UC G CU CGGCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tca-Mir-276_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0008380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Tca-Mir-276_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAGGAACUUCAUACCGUGCUCU -58
Get sequence
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