| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-2-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dlo-Mir-2-P1-v1 Dlo-Mir-2-P2a Dlo-Mir-2-P3-v1 Dlo-Mir-2-P5 Dlo-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-2-P2b Aga-Mir-2-P2b Bge-Mir-2-P2b Dan-Mir-2-P2b1 Dan-Mir-2-P2b2 Dma-Mir-2-o2 Dma-Mir-2-P2 Dme-Mir-2-P2b1 Dme-Mir-2-P2b2 Dmo-Mir-2-P2b1 Dmo-Mir-2-P2b2 Dpu-Mir-2-o2 Dpu-Mir-2-P2 Dsi-Mir-2-P2b1 Dsi-Mir-2-P2b2 Dya-Mir-2-P2b1 Dya-Mir-2-P2b2 Gpa-Mir-2-P2b Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P2b Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087235.1: 3200200-3200258 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P2b) |
Mir-71
NC_087235.1: 3199632-3199694 [+]
Ensembl
Mir-2-P1-v1 NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl Mir-2-P1-v2 NC_087235.1: 3199844-3199898 [+] Ensembl Mir-2-P2a NC_087235.1: 3200022-3200076 [+] Ensembl Mir-2-P2b NC_087235.1: 3200200-3200258 [+] Ensembl Mir-2-P3-v1 NC_087235.1: 3200363-3200424 [+] Ensembl Mir-2-P3-v2 NC_087235.1: 3200363-3200424 [+] Ensembl Mir-67-P15-v1 NC_087235.1: 3201487-3201550 [+] Ensembl Mir-67-P15-v2 NC_087235.1: 3201488-3201549 [+] Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUACUCCGUAAGGAGGAAACGCGAUCCAAUCGUCAAAAUGGUUGUGACGUGUUGUUUACUCUCAUAUCACAGCCAUUUUUGACAAGUUGGAUCGCCGUUUUUAACGUCAGCCAGGAUAGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AAUACUCCGUAAGGAGG- - C- -| CG UUGUU AAAC GCGAUCCAAU GUC AAAAUGGUUGUGA UG \ UUUG CGCUAGGUUG CAG UUUUACCGACACU AC U AUAGGACCGACUGCAAUU C AA U^ AU UCUCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Dlo-Mir-2-P2b_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGUCAAAAUGGUUGUGACGUG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Dlo-Mir-2-P2b_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UAUCACAGCCAUUUUUGACAAGUU -59
Get sequence
|
