| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aga-Mir-929 Bge-Mir-929-v1 Dan-Mir-929 Dme-Mir-929 Dmo-Mir-929 Dsi-Mir-929 Dya-Mir-929 Gpa-Mir-929 Hme-Mir-929 Tca-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087230.1: 8188508-8188568 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-929-v1) |
Mir-929-v2
NC_087230.1: 8188507-8188569 [+]
Ensembl
Mir-929-v1 NC_087230.1: 8188508-8188568 [+] Ensembl |
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| Variant | Dlo-Mir-929-v1 |
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| Seed | AUUGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGAAGAAGACCAGAACUUAACUGGGGUCAAAUUGACUCUAGUAGGGAGUCCCUGCAUUCAAUAUGGCGACUUCCUAAUAGAGUCAGGCUGACUCCUUUUAAGACGCUCACCAUGCUGCAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAGAAGAAGACCAGAAC--| CU AA G CCUGCAUU UUAA GGGGUCA UUGACUCUA UAGGGAGUC \ AAUU CCUCAGU GACUGAGAU AUCCUUCAG C AACGUCGUACCACUCGCAG^ UU CG A CGGUAUAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-929-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAUUGACUCUAGUAGGGAGUC -21
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-929-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CUUCCUAAUAGAGUCAGGCUG -61
Get sequence
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| Variant | Dlo-Mir-929-v2 |
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| Seed | AAUUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGAGAAGAAGACCAGAACUUAACUGGGGUCAAAUUGACUCUAGUAGGGAGUCCCUGCAUUCAAUAUGGCGACUUCCUAAUAGAGUCAGGCUGACUCCUUUUAAGACGCUCACCAUGCUGCAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGAGAAGAAGACCAGAA--| CU AA G CCUGCAUU CUUAA GGGGUCA UUGACUCUA UAGGGAGUC \ GAAUU CCUCAGU GACUGAGAU AUCCUUCAG C AAACGUCGUACCACUCGCA^ UU CG A CGGUAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-929-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAAUUGACUCUAGUAGGGAGUC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-929-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CUUCCUAAUAGAGUCAGGCUGA -63
Get sequence
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