| MirGeneDB ID | Dno-Mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-197 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-197 Cfa-Mir-197 Cja-Mir-197 Cpo-Mir-197 Eca-Mir-197 Hsa-Mir-197 Laf-Mir-197 Mml-Mir-197 Mmr-Mir-197 Ocu-Mir-197 Pab-Mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH562706: 297874-297934 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCACCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUGCUGGAAUCUGUGCUCCGGGGGCUGUGCCGGGUAGAGAGGGCAGUGGGAGGUAAGAGCUCUUCACCCUUCACCACCUUCUCCACUCAGCAUGGCCGGCACACUUUGGUCUACGGCACAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUGCUGGAAUCUGUGCUCCGGG--| C A CA GA UAAGAG GGCUGUGC GGGU GAGAGGG GUGG GG \ CCGGUACG CUCA CUCUUCC CACU CC C UACACGGCAUCUGGUUUCACACGG^ A C AC UC ACUUCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-197_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGUAGAGAGGGCAGUGGGAGG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-197_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUCACCACCUUCUCCACUCAGC -61
Get sequence
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