| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-197 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-197 Cfa-Mir-197 Cja-Mir-197 Cpo-Mir-197 Dno-Mir-197 Eca-Mir-197 Hsa-Mir-197 Laf-Mir-197 Mml-Mir-197 Mmr-Mir-197 Pab-Mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr13: 54594236-54594296 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCACCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUGCGAGAAUCUGUGCUCCAGGGGCUGUGCUGGGUAGAGAGGGUAGUGGGAGGUAAGAGCUCUUCACCCUUCACCACCUUCUCCACCCAGCGUGGCCAGCACACUUUGGUCUACGGCAUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUGCGAGAAUCUGUGCUCCAGG--| UG A A GA UAAGAG GGC UGCUGGGU GAGAGGGU GUGG GG \ CCG GCGACCCA CUCUUCCA CACU CC C UCUACGGCAUCUGGUUUCACACGA^ GU C C UC ACUUCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ocu-Mir-197_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGGUAGAGAGGGUAGUGGGAGG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Ocu-Mir-197_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUCACCACCUUCUCCACCCAGC -61
Get sequence
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