| MirGeneDB ID | Laf-Mir-1249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1249 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1249 Cfa-Mir-1249 Cja-Mir-1249 Cpo-Mir-1249 Dno-Mir-1249 Eca-Mir-1249 Ete-Mir-1249 Hsa-Mir-1249 Mml-Mir-1249 Mmr-Mir-1249 Mmu-Mir-1249 Ocu-Mir-1249 Pab-Mir-1249 Rno-Mir-1249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010129.1: 324783-324840 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CGCCCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUGUUCCGCAGAUUCUUGUUUGCGUGGGGAGGAGGGAGGAGAUGGGCCAAGUUCCCUCUGCCUGGAACGCCCUUCCCCCCCUUCUUCACCUGGCGAACUCCUACUCGUCCUUCAAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUUGUUCCGCAGAUUCUU- GU -| A A U CAAGUUCCCU GUUUGC GG GGAGGAGGG GG GA GGGC \ CAAGCG CC CUUCUUCCC CC CU CCCG C AGAACUUCCUGCUCAUCCU GU A^ - C U CAAGGUCCGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Laf-Mir-1249_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGAGGGAGGAGAUGGGCCAAG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Laf-Mir-1249_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- ACGCCCUUCCCCCCCUUCUUC -58
Get sequence
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