| MirGeneDB ID | Mml-Mir-1911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1911 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-1911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1911 Cfa-Mir-1911 Cja-Mir-1911 Eca-Mir-1911 Hsa-Mir-1911 Mmr-Mir-1911 Ocu-Mir-1911 Pab-Mir-1911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 111300398-111300456 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1911) |
Mir-1298
CM014356.1: 111265944-111266019 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1911 CM014356.1: 111300398-111300456 [+] UCSC Ensembl Mir-448 CM014356.1: 111349220-111349298 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | GAGUACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUAUCCAUCAUCAUUUGCUCGGCAUCUGCUGAGUACCGCCAUGUCUGUUGGGCAUCCACAGUCUCCCACCAGGCAUUGUGGUCUCUGCUGACGCUUUGCCAUUUCACCACUGGUGCCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGUAUCCAUCAUCAUUU--| UC A U U U C U CAUCC GC GGC UC GC GAG ACCGC AUGUCUG UGGG A CG UCG AG CG CUC UGGUG UACGGAC ACCC C UCCGUGGUCACCACUUUAC^ UU C U U - U C UCUGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-1911_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0028374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGUACCGCCAUGUCUGUUGGG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-1911-5p |
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| Star sequence | Mml-Mir-1911_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0028375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACCAGGCAUUGUGGUCUCUGC -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-1911-3p |
