| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-217 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-217-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bfl-Mir-217 Bla-Mir-217 Cmi-Mir-217 Gmo-Mir-217 Laf-Mir-217 Lch-Mir-217 Loc-Mir-217 Mal-Mir-217 Mdo-Mir-217 Mmr-Mir-217 Spt-Mir-217 Tni-Mir-217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Chordata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Chordata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr11: 28763760-28763820 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-217-v2) |
Mir-216-P2a
chr11: 28746204-28746265 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-216-P2b chr11: 28757018-28757079 [+] UCSC Ensembl Mir-217-v2 chr11: 28763760-28763820 [+] UCSC Ensembl Mir-217-v1 chr11: 28763761-28763819 [+] UCSC Ensembl |
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| Variant | Mmu-Mir-217-v2 |
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| Seed | UACUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAUAGUCAUUACAGUUUUUGAUGUUGCAGAUACUGCAUCAGGAACUGACUGGAUAAGACUUAAUCCCCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAACCACCAGCAAACACCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACAUAGUCAUUACAGUUUUU--| C A C C C AUAAGA GAUGUUG AG UA UGCAU AGGAACUGA UGG C CUACGAC UC GU ACGUA UCCUUGACU ACC U CCACAAACGACCACCAACAAAU^ U C U A - CCUAAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-217-v2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUACUGCAUCAGGAACUGACUGG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000679 TargetScanVert: mmu-miR-217-5p miRDB: MIMAT0000679 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-217-v2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-217-3p miRDB: MIMAT0017072 |
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| Variant | Mmu-Mir-217-v1 |
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| Seed | ACUGCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUAGUCAUUACAGUUUUUGAUGUUGCAGAUACUGCAUCAGGAACUGACUGGAUAAGACUUAAUCCCCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAACCACCAGCAAACACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAUAGUCAUUACAGUUUUU--| C A C C C AUAAGA GAUGUUG AG UA UGCAU AGGAACUGA UGG C CUACGAC UC GU ACGUA UCCUUGACU ACC U CACAAACGACCACCAACAAAU^ U C U A - CCUAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-217-v1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACUGCAUCAGGAACUGACUGGA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000679 TargetScanVert: mmu-miR-217-5p miRDB: MIMAT0000679 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-217-v1_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCC -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-217-3p miRDB: MIMAT0017072 |
